Il battistero esterno, datato alla fine del IV secolo, quando fu realizzata anche la basilica postteodoriana meridionale, sopravvive nelle forme originarie per la metà inferiore. Esternamente quadrato, il battistero aveva all’interno forma ottagonale, con nicchie semicircolari (tre delle quali successivamente chiuse) agli angoli. Due porte permettevano l’accesso dalle due sale nord e sud, una terza, più grande, si apriva a est, verso la basilica.
Il fonte battesimale attuale è di forma esagonale, con gradini che immettono nel bacino per l’immersione e fusti di colonne che lo circondarono in una fase successiva (IX secolo?). Gli scavi eseguiti negli anni Ottanta hanno permesso di evidenziare che questo fonte era stato preceduto da una vasca di forma ottagonale, coerente con l’assetto interno del battistero.